Mission Impossible, ajan Ethan Hunt'ın maceralarını temel alan bir nes oyunudur. Oyuncular, farklı görevlerde düşmanları yenmek, tuzaklardan kaçmak ve hedefleri tamamlamak için ilerlerler. Her seviyede, oyuncuların gizlice hareket etmeleri, düşmanları engellemeleri ve hedeflere ulaşmaları gerekmektedir. Oyun, dikkat, refleksler ve strateji gerektirir.
Oyuncular, görevlerin başında belirli bir süre içinde hedeflere ulaşmak zorundadırlar. Yolda, düşman ajanlarla karşılaşacaklar ve onları yenmek veya kaçmak için doğru hamleleri yapmaları gerekecektir. Ayrıca, oyuncuların karşılaşabilecekleri tuzaklara dikkat etmeleri ve bunlardan kaçmaları gerekecektir.
Kontrol tuşları oldukça basittir. Oyuncular, Ethan Hunt'ı yönlendirmek için yön tuşlarını kullanırken, Z tuşu ile zıplarlar ve X tuşu ile düşmanlara saldırırlar veya etkileşime girerler. Basit kontroller, oyuncuların oyunun tadını çıkarmasını ve aksiyon dolu maceralarda daha kolay ilerlemesini sağlar.